تعتبر بحيرة البرلس من أهم بحيرات مصر الشمالية والتى يعتمد عليها الاستهلاک السمکى فى تدبير حوالى 5.1% من احتياجاته الاستهلاکية السنوية، حيث يقدر الإنتاج السنوى بحوالى 55 ألف طن وفقاً لتقديرات عام 2004، هذا وقد تعرضت تلک البحيرة للعديد من المشاکل والتى فى مقدمتها حدوث تغيرات هيدلوجية وطبيعية أثرت على إنتاجية تلک البحيرة، حيث انخفض إنتاجها من حوالى 59.1 ألف طن عام 2001 إلى نحو 55 ألف طن عام 2004، کذلک حدثت تغيرات فى الترکيب الصنفى لانتاج تلک البحيرة نتيجة التغيرات فى هيدلوجية مياه البحيرة، حيث ازدادت إنتاجية الأسماک ذات القيمة التسويقية المنخفضة على حساب أسماک البورى، والدنيس، والقاروص، والجمبرى. ومن أهم العوامل تأثيراً فى إنتاجية البحيرة وفقاً للدراسة إنتاجية المرکب، وکفاءة البوغاز، وکمية المياه الواردة من المصارف الزراعية. وعلى ضوء ذلک يجب الاهتمام بتطهير البوغاز بصفة دورية من أجل إحداث توازن بيئى بين کمية المياه الواردة من المصارف ومياه البحر من أجل تحسين الترکيب الصنفى للأسماک، والقضاء على النباتات المائية، والبوص المنتشر فى البحيرة، بالإضافة إلى التغلب على المحددات والمعوقات التى تواجه استغلال المصايد المفتوحة داخل البحيرة کمدخل أساسى لعملية التنمية.