شهد المسجد النبوي بالمدينة المنورة (ربيع الأول 1هـ/سبتمبر 622م) في المرحلة الثالثة تطورًا في تخطيطه، حيث قام المسلمون بفعل العامل البيئي بتظليل مكان الصلاة (ظلة القبلة)، والتي اشتملت على ثلاث بلاطات مستقيمة موازية لجدار القبلة، أي تمتد من الشرق إلى الغرب، ويعد أقدم مثل قائم في العمارة الدينية الإسلامية لهذا التخطيط الموازي هو الجامع الأموي بدمشق (86-96هـ/705-715م)، وفي مرحلة تالية عرفت عمارة المسجد التخطيط العمودي بالنسبة لجدار القبلة، حيث يعد المسجد الأقصى خلال العصر الأموي أقدم مثل قائم في العمارة الإسلامية على هذا الطراز، أما التخطيط المتقاطع للبائكات والبلاطات بالنسبة لجدار القبلة فقد نشأ في مسجد رباط سوسة بتونس (206هـ/821م)، حيث تمتد موازية وعمودية في آن واحد، وهو التخطيط الذي وجد على سبيل المثال في مسجد بوفتاتة بسوسة بتونس (223-226هـ/838-841م)، وفي المسجد الجامع في سوسة بتونس (236هـ/850م)، وفي مشهد آل طباطبا (334هـ/943م) بمصر، وفي الجامع الأقمر (519هـ/1125م) بمصر .



ويحدثنا السمهودي (المتوفى سنة 911هـ/1505م) عن تمهيد الموقع من قبل الرسول، صلى الله عليه وسلم، لبناء مسجده، بما نصه :"وقال المجد : ذكر البيهقي المسجد فقال : كان جدارًا مجدرًا ليس عليه سقف، وقبلته إلى القدس، وكان أسعد بن زرارة بناه، وكان يصلي بأصحابه فيه، ويجمع بهم فيه الجمعة قبل مقدم رسول الله صلى الله عليه وسلم، فأمر رسول الله صلى الله عليه وسلم بالنخل التي في الحديقة وبالغرقد أن يقطع، وكان فيه قبور جاهلية، فأمر بها فنبشت، وأمر بالعظام أن تغيب، وكان في المربد ماء مسحل فسيره حتى ذهب – والمسحل : ممشى ماء المطر" .