يعد البابا كليمنت الثالث (1080-1100م) Clement III، أول بابا إمبراطوري في سلسلة الأباء الإمبراطوريين، واعتبر من الناحية التاريخية زائف، لأنه تولى منصب البابوية بطريقة غير شرعية، أي بطريقة مخالفة لقانون انتخاب البابا الذي أصدره البابا نيقولا الثاني Nichola II في عام 1059م، والذي أكد عليه البابا جريجوري السابع Gregory VII في عام 1075م. وترجع سبب تسميته بالبابا الإمبراطوري؛لأن الإمبراطور هو الذي قام بتعيينه، لذلك تم اعتباره بابا خاص بالإمبراطور وليس بالكنيسة؛ لأنها رفضت الاعتراف به. وكان بداية ظهور البابا الإمبراطوري كليمنت الثالث خلال النزاع الذي قام بين البابا جريجوري السابع والإمبراطور هنري الرابع Henry IV في القرن الحادي عشر الميلادي حول أحقية كل منهما بالسمو على الآخر، كما ساند كليمنت الثالث الإمبراطور هنري الرابع خلال حملاته على إيطاليا للقضاء على المتمردين ضد السلطة الإمبراطورية، كذلك قام بالتصدي للبابوات الشرعيين خلال صراعهم مع الإمبراطور هنري الرابع.