المتأمل في جذور البهرة وتاريخها يجد أن البهرة طائفة إسماعلية شيعية ؛ حيث أن الشيعة هى الجذر الأول للبهرة , فلقد انقسمت الشيعة إلى ثلاث فرق ( زيدية , کيسانية , إمامية ) , ثم تفرقت الإمامية بعد جعفر الصادق إلى فرقتين وهما ( موسوية , وإسماعلية ) , ثم انقسمت الإسماعلية بعد موت المستنصر بالله الفاطمى إلى ( نزارية , ومستعلية ) , عاشت النزارية في بلاد فارس والشام . أما المستعلية فظلت في مصر واليمن إلى أن جاء صلاح الدين في أيام العاضد , فقضى على الدولة الفاطمية بعد موته , ففروا إلى اليمن , وهناک عملوا بالتجارة , فکانوا يتنقلون بين اليمن والهند إلى أن أرسل إليهم صلاح الدين أخيه توران شاه فحاربهم في اليمن ففروا إلى الهند , وهناک أطلق عليهم اسم البهرة , وهذا الاسم معناه التجار وذلک لأنهم عملوا بالتجارة وعرفوا بها , ثم افترقت البهرة إلى فرقتين وهما :
1- البهرة الداوودية نسبة إلى داوود بن عجب شاه .
2- وسليمانية نسبة إلى سليمان الهندى , و هم المعروفون الآن بالمکارمة في اليمن .
ومن هنا نلحظ أن :
1- الشيعة کانت هى الجذر الأول والأساسى لطائفة البهرة .
2- أن الإسماعلية هى المصدر الثانى للبهرة .