تعد المياه الجوفية المصدر الأساسى للحصول على المياه بمنخفض الفرافرة, وذلک بسبب ندرة الأمطار وعدم توفر مصدر آخر للحصول عليها, فضلا عن إستخدامها فى کافة الأنشطة, لذا کان من الضرورى إجراء الدراسات حول نوعية هذه المياه, للوقوف على مدى صلاحيتها وتأثيرها على الإستخدامات البشرية المختلفة, وفى سبيل تحقيق ذلک تم اختيار أکثر من 100 بئر مياه بمنخفض الفرافرة المتمرکز وسط لصحراء الغربية المصرية بمساحة 11474,7 کم2, وأخذت منها عينات للمياه وإجراء التحاليل المعملية لعدد من العناصر مثل الأملاح الذائبة, والعسرة الکلية, ودرجة الpH, والتوصيل الکهربى, والصوديوم, والبوتاسيوم والکالسيوم, والکلور والکبريتات, بالإضافة لعنصرى الحديد والمنجنيز, وأظهرت النتائج تقارب درجات ترکيز جميع العناصر من الحدود الدنيا لها طبقا لتصنيف منظمة الصحة العالمية عام 1996, الأمر الذى أکد على أن المياه الجوفية بالمنخفض تصلح لجميع الإستخدامات کالشرب, والزراعة, والصناعة وغيرها من الإستخدامات, وذلک بعد التخلص من نسبة الحديد الذائدة بها وخاصة فى المياه المخصصة للشرب . Groundwater is the main source for obtaining water in the Farafra Depression, due to the scarcity of rain and the lack of another source to obtain it, as well as its use in all activities, so it was necessary to conduct studies on the quality of this water, to determine the extent of its suitability and its impact on various human uses, In order to achieve this, more than 100 water wells were selected in the Farafra Depression, located in the middle of the Egyptian Western Desert, with an area of ​​11474.7 km2, from which water samples were taken and laboratory analyzes of a number of elements such as dissolved salts, total hardness, pH, electrical conductivity, sodium and potassium Calcium, chlorine and sulfate, in addition to the elements of iron and manganese, and the results showed the convergence of degrees of concentration of all elements from the lower limits according to the classification of the World Health Organization in 1996, which confirmed that the groundwater in the depression is suitable for all uses such as drinking, agriculture, industry and other uses. After getting rid of the excess iron in it, especially in the drinking water.