تناولت هذه الدراسة بالتحليل أهم الجماعات اإلسالمية في الفلبين، وعالقتها بالتنظيمات اإلرهابية العالمية وفي مقدمتها تنظيم داعش، والسيناريوهات المستقبلية لهذه الحرکات، حيث تناولت نشأة هذه الجماعات من خالل النظر إلى أهم العوامل المؤثرة التي دفعت إلى ظهورها ثم تطرقت إلى مراحل نشأة کل جماعة منها على حده، وقد سعت الدراسة نحو بيان أهم المرتکزات الفکرية لکل جماعة من الجماعات اإلسالمية الثالثة وأهم القيادات في کل جماعة. کما تناولت الدراسة عالقة هذه الجماعات بتنظيم القاعدة وبحرکة الدولة اإلسالمية في العراق والشام )داعش(، ومن جهة أخرى نظر في مستقبل الجماعات اإلسالمية داخل الفلبين. وقد أکدت الدراسة على أن هناک عالقة وثيقة بين جبهة التحرير اإلسالمية مورو وتنظيم القاعدة، وهي متمثلة في مشارکة العديد من قوات الجبهة في الجهاد األفغاني ضد االتحاد السوفيتي.