يهدف البحث الحالي إلى دراسة التحديات والمعوقات التي تواجه إجراء البحوث في العالم العربي من وجهة نظر طلاب الماجستير والدکتوراه وفق متغيرات مستوى الدراسة (ماجستير ـ دکتوراه)، ونوع البحوث (علوم إنسانية ـ علوم تطبيقية)، الجنسية (مصر ـ سلطنة عمان)، ولتحقيق ذلک قام الباحثان بإجراء مسح لمعظم التحديات التي تواجه الباحثين في الوطن العربي في إجراء البحوث العلمية؛ وتوصلا إلى أن أکثر التحديات تکرارا هي؛ عدم وجود استراتيجية للبحث، وضعف المخصصات المالية، وضعف قاعدة المعلومات، وضعف مستوى البحث العلمي، وقلة البحوث المشترکة والبينية، وعدم إرتباط البحوث بقضايا التنمية. وباستخدام منهج البحث الوصفي التحليلي المقارن قام الباحثان ببناء وتطوير إستبانة تحتوي هذه الأبعاد الستة وتطبيقها على عينة بلغت 287 من طلاب الماجستير والدکتوراه في کل من سلطنة عمان ومصر. باستخدام المتوسطات الحسابية والنسب المئوية والانحرافات المعيارية واختبار (ت)؛ خلصت النتائج إلى أن مستوى التحديات التي تواجه البحث العلمي بين متوسطة ومرتفعة، کما أظهرت النتائج وجود فروق بين طلاب الماجستير والدکتوراه في کل من ضعف مستوى البحوث وقلة البحوث المشترکة لصالح طلاب الدکتوراه، ووجود فروق بين العلوم الانسانية والعلوم التطبيقية في عدم ارتباط البحوث بقضايا التنمية لصالح طلاب البحوث في العلوم الانسانية، ووجود فروق بين الطلاب المصرين والطلاب العمانيين في ضعف المخصصات المالية لصالح الطلاب المصريين، وقد أوصى البحث بإعطاء البحوث العلمية أهمية أکبر لارتباطها بقضايا التنمية والتطور.