مناهج المفسرين من الموضوعات الهامة والجديرة بالدراسة والتحليل، ومن هنا كان موضوع هذه الدراسة المعنونة بمنهج العلّامة بيان الحق النيسابوري، في كتابه "باهر البرهان في معاني مشكلات القرآن"، وكان محور مشكلة البحث قلة الدراسات عن الإمام بيان الحق، وانعدامها عن منهجه وتدبره في مصنفه –باهر البرهان في مشكلات معاني القرآن-، وتهدف هذه الدراسة إلى التعريف بالإمام بيان الحق، والتعريف بكتابه باهر البرهان في معاني مشكلات القرآن، ومنهج الإمام في كتابه، وبيان ماتفرد به من التدبر، والجديد الذي قدمه في تفسيره، وبيان التفاسير التي اعتمد عليها، وذكر المفسرين الذين تأثر بهم، وبيان فوائد التفسير، والمآخذ التي أخذت عليه، واتبعت في كل هذا المنهج الاستقرائي والوصفي والتحليلي بتتبع تفسير الإمام للآيات ودراسة الإشكالات التفسيرية المختلفة من خلال القرآن الكريم في هذا الموضوع، وكان البحث محدودا بحدود كتاب باهر البرهان في مشكلات معاني القرآن، ومنهج الإمام بيان الحق وموقفه من التدبر فيه، ومن أهم النتائج التي توصلت إليها الدراسة اهتداء الإمام النيسابوري رحمه الله تعالى بأسلوب الصحابي الجليل عبدالله بن عباس رضي الله عنه، في التفسير، والعناية بتفسير المبهمات ولعل هذا كان مقصده من تفسيره، ومن منهجه الاختصار, مما جعله أحيانا لايوفي الآية حقها من التفسير، وكذلك فإنه كان لايفسر إلا ما يراه هو أنه يحتاج إلى إيضاح، حيث يبدأ تفسير السورة من الكلمة التي يراها أنها تحتاج إلى توضيح ولايبدأ من أول السورة، ولعله بذلك قد أغفل كثيرا من الآيات والكلمات التي أراها تحتاج إلى تفسير ، وغير هذا كثير مما سيأتي بيانه في موضعه، ولقد أتى بكثير من اللطائف التدبرية في تفسيره.