هدفت الدراسة الى عزل أنواع من الفطريات المسببة لتعفن ثمار نبات الفلفل الاخضر ،  جمعت 30 عينة من ثمار الفلفل الاخضر  (Capsicum annuum L.)من الاسواق المحلية لمدينة الموصل ، تم عزل 7 اجناس فطرية من هذه الثمار  وهي Alternaria alternata (78)عزلة  و (29) Aspergillus niger عزلةو Aspergillus flavus (14) عزلةو  (11)Geotrichum  candidum   عزلة وRhizopus stolonifer  (10 ) عزلة و Rhizoctonia solani (6) عزلة و (4 ) Penicillium sp.عزلة ، وبنسب مختلفة وکانت اعلى نسبة مئوية للعزل کانت للفطر Alternaria alternata 51.3%  . وللتحري عن بعض عوامل امراضيتها للنبات تم التحري عن قدرة الانواع المعزولة لانتاج الانزيم المحلل للبروتين من قبل الفطريات المعزولة ووجد ان الفطرalternata  Alternaria کان اکثر الفطريات انتاجا للانزيم يليه الفطر Aspergillus niger وبنسبة % اما الفطر Geotrichum  candidum فلم يظهر القدرة لانتاج الانزيم . اما بالنسبة لانتاج الانزيم المحلل للدهون فقد لوحظ ان الفطريات Penicillium sp.   وRhizopus stolonifer  وAlternaria alternata  و Aspergillus niger  کان لها القابلية على انتاجه بينما لم تظهر الفطرياتRhizoctonia solani  وAspergillus flavus  و Geotrichum  candidum القابلية على انتاجه .