إستهدفت دراسة الکفاءة الفنية والإقتصادية للمحطات البحثية بمرکز بحوث الصحراء، دراسة الأسباب التى أدت إلى ضعف الدور التنموى لبعض هذه المحطات وعدم قدرتها على تحقيق الأهداف البحثية طبقاً للإستراتيجية البحثية للمرکز، رغم الإمکانيات المادية والعلمية التى يقدمها المرکز فى ظل الوضع الراهن. وقد تبين وجود 11 محطة بحثية بالمرکز تتنوع من حيث الموقع الجغرافى والأنشطه والخدمات الزراعيه وغير الزراعية بعموم الصحارى المصرية، وبدراسة الکفاءة الفنية والإقتصادية لهذه المحطات باستخدام تحليل نموذج مغلف البيانات (DEA) أظهرت النتائج أن متوسط الکفاءة الفنية للمحطات البحثية بالمرکز بلغت فى حالة العائد الثابت للسعه نحو 59.8%، فى حين بلغت فى حالة العائد المتغير للسعة نحو 78.1%. کما بلغ متوسط الکفاءة الإقتصادية للمحطات البحثيه بالمرکز نحو 60.2%، وبتقدير الحجم الأمثل للموارد الإقتصادية من حيث أعداد الموارد البشرية تبين ضرورة زيادة عدد الباحثين بالمحطات من نحو 7.45 إلى 9.91 باحث، خفض عدد الموظفين من نحو 59.45 إلى 21,09 موظف، أما من حيث الحجم الأمثل للموارد المالية تبين إمکانية خفض نسبة تغطية الميزانية للإحتياجات بالمحطات البحثيه من نحو 35.9% إلى 26.6%. وباستخدام إختبار مربع کا ()  لتحليل أهم المشاکل والمعوقات التى تواجه المحطات البحثية من حيث أهميتها النسبيه جاء ضعف صيانة الألات والمعدات فى المرتبه الأولى، يليه کل من ضعف التجهيزات العلمية والمعملية، تأخر الحصول على مستلزمات الإنتاج، عدم توافر إحتياجات الباحثين الأساسية على الترتيب. وتوصلت الدراسة لمجموعة من التوصيات أهمها ضرورة قيام المرکز باستکمال خدمات البنية الأساسية الزراعية وغير الزراعية للمحطات البحثية، ضرورة تنفيذ أعمال الصيانة الدورية للألات والمعدات، إعادة تأهيل البنية الأساسية العلمية من حيث المعامل، المکتبات الورقية والإلکترونية، قاعات التدريب، زيادة المحتوى التدريبى للکوادر البشرية بالمحطات البحثية لتعريفهم بطرق وأساليب نقل المعارف والتطبيقات التکنولوجيا الحديثة إلى المجتمعات الصحراوية المحيطة.